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Decoding Plant Genomes - A Bioinformatic Approach
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Linux Recipes for Bioinformatics: Fastq | PlantDeCode
https://plantdecode.wordpress.com/2012/02/15/linux-recipes-for-bioinformatics-fastq
Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach. Linux Recipes for Bioinformatics: Fastq. The great success of Illumina sequence technology has impulse the general use of fastq files as an easy way to store sequence and quality information in the same file. More information at wikipedia. There are several tools to manipulate fastq files. Probably for me, the most useful are:. Created by Assaf Gordon to change formats, trim sequences and do some analysis about nucleotide and quality distribution. This e...
Linux Recipes for Bioinformatics: Fasta Files | PlantDeCode
https://plantdecode.wordpress.com/2011/11/24/linux-commands-recipes-for-bioinformatics-fasta-files
Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach. Linux Recipes for Bioinformatics: Fasta Files. There are simple combinations of linux command that sometimes can replace Perl scripts to manipulate fasta files. Here some of the most used ones:. Count sequences for fasta and fastq format. Grep -c ' ' file.fasta. Grep -c '@' file.fastq. Extract sequence IDs from a fasta file. Grep ' ' file.fasta cut -d ' ' -f1 sed 's/ / ' id.txt. Count bases in a fasta file. Grep -v ' ' file.fasta wc -m. From your own site.
PlantDeCode | Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach | Page 2
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Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach. Just to Share: Species are not Immutable. November 19, 2011. I am fully convinced that species are not immutable; but that those belonging to what are called the same genera are lineal descendants of some other and generally extinct species, in the same manner as the acknowledged varieties of any one species are the descendants of that species. Furthermore, I am convinced that Natural Selection has been the main but not exclusive means of modification.
Medicago truncatula Genome Sequenced | PlantDeCode
https://plantdecode.wordpress.com/2011/12/24/medicago-truncatula-genome-sequenced
Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach. Medicago truncatula Genome Sequenced. Genome has been published in one of the last Nature issues of 2011 year ( Young ND. It is the third fagaceae species sequenced (. Increasing the genomic knowledge of this important plant family with the valuable capability of nitrogen-fixing through the root nodules. Unusual high rate of local gene duplication comparing with. 31 -fold higher),. Two paralogues have been discovered for nodulation function genes:. You a...
February | 2012 | PlantDeCode
https://plantdecode.wordpress.com/2012/02
Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach. February 23, 2012. The massive growth of the massive data production techniques such as RNAseq, makes necessary the learning of new data processing and analysis skills, or in other words, to learn how use bioinformatics tools to do your analysis. All the material used for this course can be found at BTI Plant Bioinformatics Course. Linux Recipes for Bioinformatics: Fastq. February 15, 2012. Grep -c ' @' file.fastq. It will produce an output with 2 column...
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The Fall. Allan Cubitt. Una serie feminista de un autor inglés | Desde un pequeño lugar del mundo
https://viajesalespacio.wordpress.com/2015/03/07/the-fall-allan-cubitt-una-serie-feminista-de-un-autor-ingles
Desde un pequeño lugar del mundo. The Fall. Allan Cubitt. Una serie feminista de un autor inglés. Él, sin embargo, usa los estrangulamientos como su propio porno. Lo ve con belleza, lo graba, luego se masturba mirando las fotos. En una serie norteamericana él sería un mounstro que daría miedo. Aquí es un simple padre de familia que intenta que se le respete en su trabajo. Machista, un ejemplo claro de cómo el patriarcado se impone. Y brillante es también el final, porque a pesar de todo, ante dos hombres...
The affair. Un comienzo interesante | Desde un pequeño lugar del mundo
https://viajesalespacio.wordpress.com/2015/01/23/the-affair-un-comienzo-interesante
Desde un pequeño lugar del mundo. The affair. Un comienzo interesante. Primera temporada de una serie que se titula como un culebron pero, quizá, sea una serie de intriga. No sabemos. Puede que se quede en un culebrón, puede que sea como las buenas y en la segunda temporada nos sorpresa aún más. Qué me ha gustado de la primera temporada? Está mintiendo sólo él? De verdad se quieren o son su salida de atrás ante una situación que les ha venido dada? Y eso, queramos o no, lo marca todo. Haz clic para compa...
Desde un pequeño lugar del mundo | Página 2
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Desde un pequeño lugar del mundo. La vida de adele. Abdellatif Kechiche. Me encanta que hagan historias de amor no heteronormativas. Sobre todo para descubrir que en las relaciones se perpetúan los roles. La vida de Adele es una de las pelis … Sigue leyendo →. Febrero 28, 2014 · Deja un comentario. Febrero 25, 2014 · Deja un comentario. Enero 8, 2014 · 2 comentarios. Para empezar que se … Sigue leyendo →. Enero 7, 2014 · Deja un comentario. Leon Benavente. Animo Valiente. Homeland: Qué fiasco de serie.
Sesiones ligeras: Stanstill. Adelante Bonaparte | Desde un pequeño lugar del mundo
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Desde un pequeño lugar del mundo. Sesiones ligeras: Stanstill. Adelante Bonaparte. No sé a quién se le ocurrió sacar de un escenario, sentar en un portal, en una calle gallega, a Enric Montefusco para. Cantar él con su guitarra, pero. Se lo agradezco mucho. Comparte en Facebook (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Twitter (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Tumblr (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Google (Se abre en una ventana nueva).
Gone Girl. David Fincher. Construyendo neomachismo desde la ficción | Desde un pequeño lugar del mundo
https://viajesalespacio.wordpress.com/2014/12/29/gone-girl-david-fincher-construyendo-neomachismo-desde-la-ficcion
Desde un pequeño lugar del mundo. Gone Girl. David Fincher. Construyendo neomachismo desde la ficción. Como un thriller. Pero me ha sido imposible. Malditas gafas violetas! Lo que he visto ha sido la escenografía de toda la ideología neomachista que está en un proceso de ataque bestial para recobrar valores tradicionales. Vamos punto por punto que ver esta peli en profundidad va a llevar su tiempo. La autora de la novela, también guionista de la película, se declara a sí misma como feminista. Cuando esos...
UP. Pixar | Desde un pequeño lugar del mundo
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Desde un pequeño lugar del mundo. Me encantan las pelis de dibujos animados. De verdad que sí. Pero desde que uso gafas violetas todo se complica un poco. Con lo bien que me habían hablado de Up! Una continua sonrisa en los dos nos muestra como una vida anodina, cotidiana basada en abrochar corbatas de distintos colores es el. Cómo se os queda el cuerpo? Es que Latinoamérica no es un espacio lleno de múltiples culturas y diversidades legislativas y nacionales, sino nuestra américa, pero más al sur. E...
Películas sobre violencia: Whiplash, Behind of Candelebra | Desde un pequeño lugar del mundo
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Desde un pequeño lugar del mundo. Películas sobre violencia: Whiplash, Behind of Candelebra. Será entendida como una película donde el esfuerzo personal provoca grandes resultados. La veo calificada como. Todas ellas palabras con connotaciones positivas. A todas nos gustaría pasar a la historia por ser las mejores en nuestro campo, ser admiradas, ser inmortales. Pasar a la historia, sueños de grandeza. Lo que la película nos presenta es que para conseguirlo has de estar dispuesta a sacrificarlo todo.
Maleficent. Hasta Disney está obligado a cambiar | Desde un pequeño lugar del mundo
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Desde un pequeño lugar del mundo. Maleficent. Hasta Disney está obligado a cambiar. Una feminista se acerca con cierto reparo a las películas disney. Es de sobra conocido que Disney ha generado una máquina de ventas basada del mito del amor romántico como forma de vida, innumerable merchandaising rosa basado en sus princesas, unas damas sumisas y pasivas muy alejadas del modelo de mujer del siglo XXI pero que con el que todavía se atrae a muchísimas niñas. Sin contar los parques de atracciones. Haz clic ...
En Violeta | Desde un pequeño lugar del mundo
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Desde un pequeño lugar del mundo. Http:/ miradasvioletas.wordpress.com/. Comparte en Facebook (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Twitter (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Tumblr (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Google (Se abre en una ventana nueva). Haz clic para compartir en Pocket (Se abre en una ventana nueva). Haz clic aquí para compartir en LinkedIn (Se abre en una ventana nueva). Click to email (Se abre en una ventana nueva).
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PlantDeCode | Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach
Decoding Plant Genomes – A Bioinformatic Approach. Tomato genome project, an brief historic perspective. July 21, 2012. Some fruits have a long ripening, and the tomato genome project has been one of them. The international consortium started in 2004 as a Bac-by-Bac sequencing project on Solanum lycopersicum var. Heinz 1706, where each participant had assigned a chromosome. And other using the public software, CABOG. Involved a central repository were the data was placed and different groups downloading ...
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